Die Physiotherapie findet vor allem Anwendung bei Erkrankungen des Bewegungsapparates, z.B. Arthrose, Bandscheibenvorfall ("Dackellähme"), Kreuzbandriss, HD, ED, OCD, Spondylose und Muskelerkrankungen wie Atrophien oder Kontrakturen.
Neben orthopädischen Problemen können auch neurologische Erkrankungen wie Degenerative Myelopathie oder Ataxien durch die Physiotherapie unterstützt werden.
Zur Physiotherapie gehören neben Massagen, Wärmeanwendungen in Form von Infrarot, passivem Bewegen und Manueller Therapie auch aktive Formen der Krankengymnastik, z.B. Gerätetraining oder das Unterwasserlaufband.